qPCR与圆二色谱CD分别可以解决哪些科研问题？

　　qPCR 解决的是“核酸有多少、有没有、变了没有”的问题;圆二色谱 CD 解决的是“蛋白质/核酸构象怎样、稳不稳定、有没有发生相互作用”的问题。两者一个偏分子定量与诊断，一个偏结构表征与稳定性评价。

　　qPCR 主要能解决这些问题

　　1. 基因表达定量

　　检测 mRNA、miRNA、lncRNA 在不同组织、处理条件或疾病状态下的表达差异，常用于 RNA-seq 结果验证、药物干预效果评价、基因敲除/沉默效率确认。

　　2. 病原体检测与病毒载量监测

　　用于病毒、细菌、真菌等核酸的快速检测，如 HIV、HBV、HCV、SARS-CoV-2、结核分枝杆菌等，也可做耐药基因和寄生虫检测。

　　3. 基因变异与拷贝数分析

　　可检测 SNP、CNV、肿瘤驱动基因突变、基因编辑效率、甲基化相关分析等，适合遗传病筛查、肿瘤分子分型和药物基因组学研究。

　　4. 生物制药质量控制

　　用于宿主细胞 DNA 残留、支原体污染、病毒载体滴度、NGS 文库定量等质控环节。

　　5. 食品、环境与农业检测

　　可检测转基因成分、食源性致病菌、过敏原、环境微生物，以及动植物基因型鉴定和病原体筛查。

　　圆二色谱 CD 主要能解决这些问题

　　1. 蛋白质二级结构分析

　　通过远紫外区 190–250 nm 扫描，判断 α-螺旋、β-折叠、无规卷曲等二级结构比例，评估突变、表达条件改变或纯化工艺变化是否影响蛋白构象。

　　2. 蛋白质三级结构与局部环境变化

　　近紫外区 250–320 nm 可反映 Phe、Tyr、Trp 等芳香氨基酸所处的手性环境，用于判断蛋白是否正确折叠、是否发生局部构象重排。

　　3. 热稳定性与化学稳定性评价

　　通过变温 CD 或化学变性滴定，可获得蛋白或核酸的熔解温度 Tm、去折叠行为和稳定性差异，适合抗体、多肽、重组蛋白的处方筛选和批次比较。

　　4. 分子相互作用研究

　　可检测蛋白-小分子、蛋白-蛋白、DNA-小分子、RNA-适配体等结合是否引起构象变化，并可辅助估算结合参数。

　　5. 核酸构象与手性分子表征

　　可区分 B-DNA、Z-DNA 等构象变化，也可用于手性药物、天然产物、多肽药物的绝对构型判断和光学纯度分析。

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