药物与靶点亲和力测定是药物发现与优化的核心环节,用于量化小分子、抗体或肽类药物与其生物靶标(如蛋白、酶、受体、核酸)的结合强度。亲和力通常以平衡解离常数(KD)表示,KD 越小,结合越强。下面是主流测定方法、选择策略及行业实践指南。
方法选择指南(按药物类型)
1. 小分子药物(<900 Da)
首选:SPR 或 BLI
可测动力学(koff 决定药效持续时间)
无需标记(避免修饰影响活性)
补充:ITC
获取 ΔH/ΔS,指导结构优化(如增加氢键 vs. 疏水作用)
高通量筛选:FP / TR-FRET(需标记靶点或配体)
案例:激酶抑制剂开发中,SPR 测得 koff > 1 小时 → 体内药效显著延长。
2. 治疗性抗体(IgG, scFv, 双抗)
金标准:SPR(Biacore™)
提供 ka/kd/KD,用于 IND 申报
支持表位 binning(竞争结合分析)
高通量初筛:Octet® BLI
96 孔板格式,快速比较数十个候选分子
细胞水平验证:流式细胞术 或 Cell-based SPR
注意:测 IgG 时得到的是表观亲和力(avidity),需用 Fab 片段测真实 affinity。
3. 难成药靶点(如蛋白-蛋白相互作用 PPI)
弱亲和力(KD > 10 μM):ITC(直接测热,不受背景干扰)
无合适标记位点:MST(利用 intrinsic 荧光,如色氨酸)
来源:网络