肠道微生物多样性分析是研究宿主-菌群互作、疾病机制、营养干预及药物效应的核心手段。其目标是系统评估肠道菌群的物种组成、丰度分布及功能潜力,常用 16S
rRNA 基因测序(细菌/古菌) 或 宏基因组测序(全微生物组) 技术。
1. 样本类型
粪便:常用,代表结肠菌群
肠腔内容物:分段取样(空肠、回肠、结肠),更精准
黏膜刮取物:反映黏附菌群(与免疫更相关)
2. 采集与保存
立即冻存于 –80℃(避免 –20℃)
可用 DNA/RNA 保护剂(如 OMNIgene·GUT、RNAlater)
避免反复冻融
3. 对照设置
阴性对照:无菌 PBS 经相同提取流程 → 监测试剂污染
阳性对照:Zymo BIOMICS Microbial Community Standard
4. 样本量估算
小鼠实验:每组 n ≥ 6–8(考虑个体差异)
人群研究:n ≥ 30/组(若效应量中等)
来源:网络