一、实验原理
qPCR通过荧光信号实时监测目标基因的扩增,其Ct值与模板起始量呈负相关。若目标酶对应的基因表达量与酶活性正相关,可通过qPCR定量该基因的mRNA水平,间接反映酶含量。
二、关键步骤
样本处理
RNA提取:使用Trizol法提取细胞总RNA,检测纯度(OD260/280≈1.8-2.0)及完整性(RIN值≥7)。
逆转录:将RNA转化为cDNA(避免基因组DNA污染),推荐使用两步法RT-qPCR。
引物设计
针对目标酶基因设计特异性引物,长度20-25bp,GC含量45-55%,避免引物二聚体。
内参基因(如GAPDH)用于校正样本间差异。
qPCR反应
体系配置:含cDNA模板、引物、TaqMan探针(或SYBR Green染料)、dNTPs及聚合酶。
循环参数:变性(95℃)、退火(Tm-5℃)、延伸(72℃),共40循环。
数据分析
标准曲线法:构建已知浓度标准品的扩增曲线,通过Ct值计算样本中目标基因拷贝数。
相对定量:采用2^(-ΔΔCt)法,比较实验组与对照组的基因表达差异。
三、注意事项
特异性验证:SYBR Green染料需进行熔解曲线分析,确保单一扩增峰。
污染控制:使用UNG酶防气溶胶污染,设置阴性对照。
动态范围:确保样本Ct值在标准曲线线性范围内(通常R²≥0.98)。
四、应用场景
酶活性研究:如测定细胞中过氧化物酶(CAT)或乳酸脱氢酶(LDH)的基因表达水平。
药物筛选:评估化合物对酶基因表达的调控作用。
来源:网络