在表面等离子共振(SPR)实验中,合理设置对照组是确保结合数据准确、排除非特异性干扰并验证实验系统有效性的关键。根据实验规范,SPR实验的阳性对照与阴性对照设置方法如下:
一、 阴性对照(Negative Control)设置方法
阴性对照的核心目的是验证整个实验系统是否存在非特异性反应,排除假阳性信号及背景干扰。
参比通道对照(Reference
Channel):在芯片上设置一个未固定配体(Ligand)的参比通道。在进样分析物(Analyte)时,该通道仅注入运行缓冲液。通过扣除参比通道的信号,可以有效消除由缓冲液、试剂或仪器本身带来的基础背景信号及非特异性结合干扰。
裸露芯片表面测试:在进行正式实验前,可让分析物流过没有任何固定化配体的裸露传感器表面。若观察到显著水平的非特异性结合(NSB),则需通过调整缓冲液pH值、增加盐浓度、添加非离子表面活性剂或蛋白质阻断添加剂等策略来优化实验条件。
空白缓冲液对照:在设置分析物浓度梯度时,必须包含一个空白缓冲液对照(即不含分析物的运行缓冲液),用于校准仪器的本底值(Baseline)。
二、 阳性对照(Positive Control)设置方法
阳性对照的核心作用是确认实验体系(如芯片活化、配体固定、仪器检测)能够正常检测到目标信号,排除假阴性结果,并校准实验灵敏度。
已知互作分子对照:使用已知能够与固定化配体发生特异性结合的分子作为阳性对照。例如,在研究SARS-CoV-2
PLpro酶与其抑制剂时,可使用已验证的对照抑制剂(如GRL0617)作为阳性对照进样,以确认PLpro蛋白在芯片上保持了正确的结合活性。
互补野生型蛋白对照:在蛋白质相互作用研究中,可使用具有互补野生型界面的分析物作为正向结合对照。例如,在研究ETV6
PNT结构域聚合界面时,使用野生型PNT结构域作为阳性对照,验证结合系统的有效性。
系统有效性验证:在每次正式实验运行前或实验批次中,通过阳性对照确认配体固定量、仪器流速及检测器响应均处于正常状态。若阳性对照未显示出预期的结合信号,则说明实验条件存在问题(如配体失活或试剂失效),需重新调整。
三、 对照组设置的核心原则
条件严格匹配:阳性对照与阴性对照的处理条件(如温度、流速、进样时间)必须与实验组完全一致,以确保数据的可比性。
避免交叉污染:对照样本与实验样本需分区域或按合理顺序操作,防止交叉污染导致结果混淆。
预实验验证:在正式实验前,建议先进行预实验验证对照组的有效性,避免因对照失效导致整体实验失败。
来源:网络