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抑制剂筛选SPR筛选模式

更新时间:2026-03-19 所属栏目:行业信息

  基于表面等离子体共振 (SPR) 的抑制剂筛选 是一种强大的生物物理技术,广泛应用于药物发现的早期阶段(Hit Identification)和先导化合物优化(Lead Optimization)。

  与传统的生化酶活实验(如荧光、发光法)不同,SPR 直接检测分子间的结合事件,无需标记,能提供实时的结合动力学数据 ( kon,koffkon​,koff​ ) 和亲和力 ( KDKD​ ),并能有效区分特异性结合与非特异性结合。

  主要筛选模式 (Screening Modes)

  根据通量和目的不同,SPR 筛选主要分为三种模式:

  1. 直接结合筛选 (Direct Binding Screen)

  原理:将靶蛋白固定在芯片上,依次流过化合物库中的小分子。

  适用:片段筛选、中等通量筛选 (几百到几千个化合物)。

  流程:

  固定靶蛋白。

  注入单浓度化合物(通常为高浓度,如 100 μμ M - 1 mM,取决于溶解度)。

  观察响应信号 (RU)。超过阈值(如 > 3-5 RU 或 > 3倍标准差)的视为 Hit。

  对 Hit 进行浓度梯度测试以测定 KDKD​ 。

  优点:直观,直接发现结合分子。

  缺点:通量相对较低;需排除非特异性结合(疏水性化合物易吸附)。

  2. 竞争结合筛选 (Competition / Displacement Screen) —— 常用的高效筛选模式

  原理:利用一个已知的高亲和力参考配体(Reference Ligand),检测待测化合物是否能竞争性地抑制参考配体的结合。

  适用:针对特定活性位点的筛选、验证已知结合位点的抑制剂、高通量二级筛选。

  流程 (Sandwich 或 Pre-mix 模式):

  模式 A (预混合):将化合物与参考配体混合后注入蛋白芯片。若化合物是抑制剂,参考配体的结合信号会下降。

  模式 B (三明治/顺序注入):先注入化合物,不清洗(或快速清洗),紧接着注入参考配体。若化合物占据了结合位点,参考配体的结合信号会降低或消失。

  优点:

  高灵敏度:即使小分子本身信号弱,也能通过参考配体信号的显著变化检测出来。

  位点特异性:只筛选针对参考配体结合位点(通常是活性中心)的抑制剂,自动过滤掉结合在别处的非特异性分子。

  高通量:适合自动化运行。

  3. 表位/位点作图 (Epitope/Site Mapping)

  原理:确定抑制剂结合在蛋白的哪个区域(是否与底物竞争,是否为变构位点)。

  方法:类似竞争筛选,但使用不同的已知配体(如底物类似物、抗体、变构调节剂)作为探针,看抑制剂是否影响它们的结合。

       来源:网络

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