RNA 荧光原位杂交(Fluorescence In Situ Hybridization for RNA,
RNA-FISH)是一种高灵敏度、高特异性的分子细胞学技术,用于在完整细胞或组织切片中直接可视化特定RNA分子的空间分布、丰度及亚细胞定位(如核内、胞质、应激颗粒等)。
步骤1:样本固定与通透
固定:4% 多聚甲醛(PFA)室温10–15分钟,保持RNA完整性与细胞形态;
通透:0.1–0.5% Triton X-100 或 70% 乙醇(–20°C),使探针进入细胞;
避免RNase污染:所有试剂需DEPC处理,操作戴手套。
步骤2:预杂交(可选)
加入含tRNA、鲑鱼精DNA的杂交缓冲液,封闭非特异性结合位点。
步骤3:杂交
将荧光探针加入杂交缓冲液(含甲酰胺、SSC、dextran sulfate),覆盖样本;
37–42°C 孵育数小时至过夜(甲酰胺降低Tm值,提高特异性)。
步骤4:严格洗脱
用含甲酰胺的SSC缓冲液梯度洗脱(如2×SSC → 0.2×SSC),去除非特异结合探针;
洗脱温度接近杂交Tm值,确保高信噪比。
步骤5:封片与成像
DAPI复染细胞核;
抗淬灭封片剂(如ProLong Gold)封片;
使用共聚焦显微镜或超分辨显微镜(STORM/PALM)采集图像。
来源:网络