Q1:通过Co-IP后WB验证发现,没有想要的⽬的条带?
A1:1)有可能是样品被蛋⽩酶降解,对应的策略是需要添加蛋⽩酶抑制剂,所有操作保持4℃以下冰上操作并防⽌冻融。
2)有可能是抗体浓度太低导致条带较浅,则需要调整IP或WB抗体浓度,必要时设⽴浓度梯度,摸索最佳浓度。
3)抗体亲和⼒太低,选⽤适合于IP或者WB的抗体。
4)有的IP抗体未与磁珠结合,这种情况需选⽤适合IP的磁珠。
5)若Tag未暴露在融合蛋⽩构象的表⾯,则需改变Tag融合表达部位。
6)裂解液盐碱度太⾼,需⽤低盐碱度的裂解液。
7)抗体选择不当,更换抗体。
Q2:通过Co-IP后WB验证发现,虽然可⻅⽬的条带,但是背景很⾼,原因是什么?
A2:是由多方面原因造成的:
1)由于⾮特异蛋⽩结合导致背景⾼,若要避⾊⾮特异性蛋⽩结合,则需要在⽆⾎清溶液中裂解细胞,且在免疫沉淀前⽤protein(A/G)珠⼦预洗,在免疫沉淀后增加漂洗次数和盐碱度(⾼盐或去垢剂)。
2)实验仪器或试剂被污染,使⽤洁净的仪器及试剂。
3)转移膜上的⾮特异吸附导致背景⾼,实验操作过程中戴⼿套,使⽤镊⼦来取,不要接触膜转移⾯。
4)制备样品中可能有不完全溶解的⼤的蛋⽩复合体,则在制备样品后进⾏短暂超声处理(3次,每次5秒钟),然后离⼼,取上清后进⾏后续试验。
5)洗涤不彻底,则需要多次洗涤,并增加洗涤液中的NaCl和去垢剂浓度。
6)可能有⾮特异性蛋⽩吸附于珠⼦上,则须进⾏Preclearing以排⾮特异性吸附。
7)抗体本⾝待异性不好可能导致背景⾼,则须选择合适的抗体,可以考虑单抗。
8)使⽤了过多的细胞或组织进⾏裂解导致背景⾼,则须减少样本量,推荐100-500μg细胞裂解液。
9)蛋⽩降解也可能出现⾼背景的情况,尽量使⽤新鲜制备的样品。
蛋白质和核酸是组成生命的主要生物大分子,它们各自具有其结构特征和特定功能。核酸具有传递遗传信息等功能,而蛋白质则贯穿生命的所有生理过程。
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